[发明专利]高通量生物芯片检测结果的一种判读工具

摘要

本发明涉及到一个对生物芯片的检测结果进行判读的工具，尤其是设计出用于对单张芯片容量在一千个探针以上的高通量生物芯片的检测结果。该工具整合了以下三类有代表性的芯片判读方法，包括：1)基于正常样本进行背景校正的方法；2)基于超几何分布对组合探针进行复合判读的方法；3)基于已知数据库的探针结合自由能谱的比对方法。

主权项

使用基于正常样本进行背景校正的方法，去除动物体内分布正常的微生物群落背景。首先需要用制备的芯片去杂交分析多份正常人或者动物取得的样本，得到每种微生物探针在正常情况下信号强度的均值Mnorm以及相应的标准差SDnorm。然后，使用芯片与待测样本进行杂交，得到每种探针的信号强度值t。全部的信号强度值都需要进行对数变换，以减小噪音信号的影响。对于每一种微生物的每一个探针，我们都可以计算其在待测样本中的富集程度，使用Z‑score进行度量： Z - score ( t ) = t - M norm SD norm .