[发明专利]谱库的生成方法和串联质谱谱图鉴定方法有效
申请号: | 201010208640.3 | 申请日: | 2010-06-13 |
公开(公告)号: | CN101871945A | 公开(公告)日: | 2010-10-27 |
发明(设计)人: | 叶叮;付岩;孙瑞祥;贺思敏 | 申请(专利权)人: | 中国科学院计算技术研究所 |
主分类号: | G01N33/68 | 分类号: | G01N33/68;G01N27/62 |
代理公司: | 北京泛华伟业知识产权代理有限公司 11280 | 代理人: | 王勇 |
地址: | 100190 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | 本发明提供一种谱图数据库的生成方法,包括:选取已解析的实验串联质谱谱图,所述已解析的串联质谱谱图中包括母离子肽序列、电荷、修饰类型和位点在内的信息;从所述已解析的实验串联质谱谱图中去除冗余谱图,得到代表谱;将所述代表谱所对应的母离子肽序列按理论碎裂模式进行划分,得到与所述代表谱相对应的理论谱;合并所述代表谱与所对应的理论谱,得到优化谱;对所述优化谱做谱峰标注,由谱峰标注后的优化谱生成谱图数据库。本发明还提供了一种串联质谱谱图鉴定方法。本发明在将候选谱与待解析串联质谱谱图匹配的过程中,考虑了可能由潜在修饰引入的谱峰质荷比偏移,使得含修饰的碎片离子谱峰得到匹配,达到更好的修饰谱图鉴定效果。 | ||
搜索关键词: | 生成 方法 串联 质谱谱 图鉴 | ||
【主权项】:
一种谱图数据库的生成方法,包括:步骤1)、选取已解析的实验串联质谱谱图,所述已解析的串联质谱谱图中包括母离子肽序列、电荷、修饰类型和位点在内的信息;步骤2)、从所述已解析的实验串联质谱谱图中去除冗余谱图,得到代表谱;步骤3)、将所述代表谱所对应的母离子肽序列按理论碎裂模式进行划分,得到与所述代表谱相对应的理论谱;步骤4)、合并所述代表谱与所对应的理论谱,得到优化谱;步骤5)、对所述优化谱做谱峰标注,由谱峰标注后的优化谱生成谱图数据库。
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