[发明专利]MS/MS数据处理

摘要

一种从前体离子种类的碎片来识别这些前体离子种类的方法包括获得多个前体离子种类以及它们的碎片的质谱，该质谱达到高质量准确度。然后，扫描从裂解多个前体离子种类获得的该碎片质谱，它识别出其组合质量与这些前体离子种类中的一个的质量相匹配的多个碎片对。一旦已经将多个碎片离子对与前体离子相匹配，将复合的碎片离子谱分解成多个部分，每个碎片对一个部分。继续进行分析直到没有进一步的对被识别出。然后通过将该复合碎片谱的分解的多个部分整合在一起来对于每个前体样本离子重构一种简化的碎片离子谱。将这些得到的重构的简化的碎片谱发送给一种搜索引擎，该搜索引擎返回对每个合成的碎片离子谱的可能候选者的一个分数分类列表。

主权项

一种从前体离子种类的碎片来识别这些前体离子种类的方法，该方法包括：(a)确定表示多个前体离子种类的质量的一个量；(b)将该多个前体离子种类的离子裂解以形成从该多个前体离子衍生出的多个碎片离子；(c)对从多个前体离子种类衍生出这些碎片离子一起/同时进行质量分析；(d)将多个碎片离子种类的一个或多个样本集合指定给该多个前体离子种类中的特定一个，该样本集合或每个样本集合包括多个碎片离子种类，这些碎片离子种类在步骤(c)中所确定的组合质量与这些碎片离子种类所指定的这些前体样本离子种类中特定一个的组合质量相对应；(e)对于这些前体离子种类中的一个或多个，将识别(i)在步骤(a)中所识别的该特定前体样本离子种类的质量，以及(ii)对于该特定前体离子种类在所指定的样本集合或每个指定的样本集合中该多个碎片离子种类的质量的样本数据传送给一个比较装置，用于对应地将表示该前体和所指定的碎片离子种类的质量的多个量与在参比碎片离子数据和参比前体离子数据的一个或多个参比集合中代表离子质量的多个量进行比较；并且(f)从该比较装置接收表示所述比较的结果的信息，该信息试图识别出已经对其指定了该多个碎片样本离子种类的前体离子种类。