[发明专利]确定基因毒性的方法

摘要

本文提供了基于接触产生的基因组反应确定化合物基因毒性的方法和试剂。

主权项

1.确定测试化合物基因毒性的方法，所述方法包括：(a)用所述测试化合物接触活的测试细胞；(b)确定选自如下的指示基因的表达水平的变化：Prelp(富含脯氨酸精氨酸末端富含亮氨酸重复)、Sesn2(Sestrin 2)、4833427G06 Rik(RIKEN cDNA)、Dda3(差异显示并为p53激活)、Usp30(泛素特异性蛋白酶30)、0610013D04 Rik(RIKEN cDNA)、Slc19a2(可溶载体家族19(硫胺素转运蛋白)，成员2)、Trp53inp1(转化相关蛋白质53，诱导型核蛋白1)、D4Ertd421e(DNA区段，染色体4，ERATO Doi 421，表达的)、Shcbp1(Shc SH2结构域结合蛋白1)、Mki67(由MAb Ki67鉴定的抗原)、Phex(磷酸调控神经内肽酶(X染色体))、Tk1(胸苷激酶1)、Mmhead(小家鼠15日胚胎头部cDNA克隆)、Osbpl6(氧固醇结合蛋白样6)、Mphosph1(M期磷蛋白)、Ephx1(环氧化物水解酶1(微粒体异生素水解酶))、Top2a(拓扑异构酶(DNA)IIα)、Ccng1(细胞周期素G1)、Plf(增殖蛋白)、Np95(核蛋白95)、Rad51ap1(RAD51相关蛋白1)、Nos3(一氧化氮合成酶3，内皮细胞)、2610005B21 Rik(RIKEN cDNA)、Brca1(乳腺癌1)、Stk18(丝氨酸/苏氨酸激酶18)、Calmbp1(钙调蛋白结合蛋白1)、Lek1(亮氨酸、谷氨酸、赖氨酸家族1蛋白)、Smc2l1(SMC2染色体结构维持蛋白2样1)、E2f7(E2F转录因子7)、Hmmr(透明质酸介导的移动受体(RHAMM))、Nusap1(核仁及纺锤体相关蛋白1)、Fbxo5(f-box唯一蛋白31)、Slc19a2(可溶载体家族19(硫胺素转运蛋白)，成员2)、9030617O03 Rik(RIKENcDNA)、Ly6e(淋巴细胞抗原6复合物，基因座E)、6530401L14 Rik(RIKEN cDNA)、Mad3(Max二聚体蛋白3)、Hmgb2(高迁移率族蛋白2)、Kif11(驱动蛋白11)、Mad2l1(MAD2(有丝分裂阻滞缺陷同源物)样1(酵母))、Asf1b(ASF1抗静默功能1同源物B(酵母菌属))、Mcm3(微型染色体维持缺陷3(酵母菌属))、MGC：32192(小家鼠cDNA克隆MGC：32192 IMAGE：5006129)、Foxm1(叉头框蛋白M1)、Anxa8(膜联蛋白A8)、Slc35a5(可溶载体家族35，成员A5)、E030024M05 Rik(RIKENcDNA)、Cks2(CDC28蛋白激酶调控亚基2)、Cilp(软骨中间层蛋白)、Tacc3(包含卷曲螺旋的酸性转化蛋白3)、Prc1(胞质分裂蛋白调控因子1)、2610509G12 Rik(RIKEN cDNA)、2810417H13 Rik(RIKEN cDNA)、Pbk(PDZ结合激酶)、Capn6(钙蛋白酶6)、Gmnn(Geminin)、Mcmd4(微型染色体维持缺陷4同源物)、Ccna2(细胞周期素A2)、Pola1(DNA聚合酶α1，180kDa)、Hmgb3(高迁移率族蛋白3)、Tagln(Transgelin(平滑肌22蛋白))、1600013K19 Rik(RIKEN cDNA)、Serpine1(丝氨酸(或半胱氨酸)蛋白酶抑制剂E进化枝成员1)，Wig1(野生型p53诱导的基因1)、Hgf(肝细胞生长因子(分散因子))、Gepi(葡糖胺-6-磷酸脱氨酶，Birc5(含杆状病毒IAP重复5)、Prim1(DNA引发酶p49亚基)、Rb (成视网膜细胞瘤样1(p107))、Pcna(增殖细胞核抗原)、E130315 K1 Rik(RIKEN cDNA)、2610019I03 RIK(RIKEN cDNA)；其中，至少1.5倍的表达增强表明所述化合物具有基因毒性。